Das Klavierduo Borota und Knebel beschäftigt er sich vorallem mit ungewöhnlichen Besetzungen der Klaviermusik. Die Faszination für die unbegrenzten Möglichkeiten des vierhändigen Klavierspiels führte 1990 an der Staatlichen Hochschule für Musik Trossingen die Pianisten Ljiljana Borota und Christian Knebel zusammen, die ein Duo formten, das sich schwerpunktmäßig mit unedierten und wenig bekannten Werken namhafter Meister des 19. und 20. Jahrhunderts beschäftigt.

Daraus entstanden zahlreiche Rundfunk- und CD-Einspielungen, die sogar in Japan Anklang fanden. Tourneendurch Deutschland, Osteuropa und Lateinamerika gehören zu den wichtigsten Konzertterminen.

Das Klavier ist in seiner Vielseitigkeit und seinen Kombinationsmöglichkeiten immer gut für neue Experimente. Seine Zuneigung für Improvisation und Multimedia führte Borota und Knebel dazu, Konzertprogramme traditionell und multimedial zu mischen. Daraus resultiert ein ungeahntes Adaptionserlebnis beim Zuhörer.

Die melodramatische Arbeit an Mendelssohns Sommernachtstraum in der Originalfassung für Klavier zu vier Händen und Schauspiel führte Borota & Knebel mit dem Schauspieler Markus Löchner zusammen. Mit ihm ist für eine Tournee in der Konzertsaison 2009/10 eine melodramatische Version des „Kleinen Prinzen“ von Saint- Exupéry entstanden.

Zusammen mit Ljiljana Borota bekam Christian Knebel 2008 den Auftrag, für den Verlag „Wiener Urtext Edition“ die praxisgerechte Urtext-Ausgabe der vierhändigen Werke Robert Schumanns mit Fingersätzen und Hinweisen zur Interpretation anzufertigen. Die Ausgabe enthält zusätzlich zu den bekannten Werken Schumanns Neuveröffentlichungen.